Volume 08(2003)

目次 / Table of Contents
所長の目線
Director’s Eye

吉良 爽 KIRA Akira

(財)高輝度光科学研究センター 副理事長、放射光研究所長 Director General of Synchrotron Radiation Research Laboratory, Vice President of JASRI

Volume 08, No.3 Pages 133 - 134pdfDownload PDF (23 KB)
所長の目線
Director’s Eye

吉良 爽 KIRA Akira

(財)高輝度光科学研究センター 副理事長、放射光研究所長 Director General of Synchrotron Radiation Research Laboratory, Vice President of JASRI

Volume 08, No.4 Page 213pdfDownload PDF (20 KB)
所長の目線
Director’s Eye

吉良 爽 KIRA Akira

(財)高輝度光科学研究センター 副理事長、放射光研究所長 Director General of Synchrotron Radiation Research Laboratory, Vice President of JASRI

Volume 08, No.5 Page 283pdfDownload PDF (20 KB)
所長の目線
Director’s Eye

吉良 爽 KIRA Akira

(財)高輝度光科学研究センター 副理事長、放射光研究所長 Director General of Synchrotron Radiation Research Laboratory, Vice President of JASRI

Volume 08, No.6 Page 392pdfDownload PDF (17 KB)
新年ご挨拶
New Year’s Greeting

伊原 義徳 IHARA Yoshinori

(財)高輝度光科学研究センター 理事長 JASRI, President

Volume 08, No.1 Page 1pdfDownload PDF (15 KB)
所長の目線
Director’s Eye

吉良 爽 KIRA Akira

(財)高輝度光科学研究センター 副理事長、放射光研究所長 JASRI Vice President, Director of JASRI Research Sector

Volume 08, No.1 Page 2pdfDownload PDF (12 KB)
所長の目線
Director’s Eye

吉良 爽 KIRA Akira

(財)高輝度光科学研究センター 副理事長、放射光研究所長 JASRI Vice President, Director of JASRI Research Sector

Volume 08, No.2 Page 60pdfDownload PDF (13 KB)

1. SPring-8の現状/PRESENT STATUS OF SPring-8

第10回共同利用期間(2002B)において実施された利用研究課題
The Experiments in the 10th Research Period (2002B) at the Public Beamlines of SPring-8

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.3 Pages 135 - 146pdfDownload PDF (107 KB)
SPring-8蓄積リングのトップアップ運転(その1)
Top-up Operation at SPring-8 (Part-1)

田中 均 TANAKA Hitoshi、大熊 春夫 OHKUMA Haruo

(財)高輝度光科学研究センター 加速器部門 Accelerator Division, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 298 - 304pdfDownload PDF (106 KB)
SPring-8運転・利用状況
SPring-8 Operational News

(財)高輝度光科学研究センター 所長室 計画調整グループ Planning and Coordination Section, Director's Office, JASRI

Volume 08, No.3 Page 147pdfDownload PDF (17 KB)
SPring-8蓄積リングのトップアップ運転(その2)
Top-up Operation at SPring-8 (Part-2)

木村 洋昭 KIMURA Hiroaki

(財)高輝度光科学研究センター 所長室 計画調整グループ Planning and Coordination Section, Directorユs Office, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 305 - 308pdfDownload PDF (58 KB)
重点研究課題について
On the Priority Proposal at SPring-8

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.3 Pages 148 - 149pdfDownload PDF (132 KB)
第12回(2003B)利用研究課題の採択について
The Proposals Accepted for Beamtimes in the 12th Public Use Term 2003B

放射光利用研究促進機構 (財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 Organization for the Promotion of Synchrotron Radiation Research・User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 309 - 326pdfDownload PDF (93 KB)
長期利用研究課題2003Bの募集について
Call for the Beam Time Application for Long Term Experiments

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.3 Pages 150 - 151pdfDownload PDF (19 KB)
2003B利用研究課題選定委員会を終えて
Report of the Proposal Review Committee on the 12th Public Research Term 2003B

佐々木 聡 SASAKI Satoshi

東京工業大学 応用セラミックス研究所 Materials and Structures Laboratory, Tokyo Institute of Technology

Volume 08, No.5 Pages 327 - 329pdfDownload PDF (23 KB)
2003B SPring-8共用ビームライン利用研究課題の募集について
Call for the Beam Time Application for the Public Beamlines at SPring-8

放射光利用研究促進機構 (財)高輝度光科学研究センター Organization for the Promotion of Synchrotron Radiation Research, JASRI

Volume 08, No.3 Pages 152 - 169pdfDownload PDF (149 KB)
第11回共同利用期間(2003A)において実施された利用研究課題
The Experiments in the 11th Research Period (2003A) at the Public Beamlines of SPring-8

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 330 - 342pdfDownload PDF (104 KB)
2003B ナノテクノロジー総合支援プロジェクト対象課題の募集について
Call for the Beam Time Application for Nanotechnology Experiments

放射光利用研究促進機構 (財)高輝度光科学研究センター Organization for the Promotion of Synchrotron Radiation Research, JASRI

Volume 08, No.3 Pages 170 - 173pdfDownload PDF (27 KB)
産業界専用ビームライン(BL16B2, BL16XU)の中間評価について
Interim Evaluation of Industrial Consortium Beamlines (BL16B2, BL16XU)

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.5 Page 343pdfDownload PDF (17 KB)
2003B トライアルユース課題の募集について
Call for the Beam Time Application for Trial Use Experiments

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.3 Page 174pdfDownload PDF (15 KB)
SPring-8運転・利用状況
SPring-8 Operational News

(財)高輝度光科学研究センター 所長室 計画調整グループ Planning and Coordination Section, Directorユs Office, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 344 - 345pdfDownload PDF (18 KB)
論文発表の現状
Publications Resulting from Experiments at SPring-8

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.3 Pages 175 - 176pdfDownload PDF (27 KB)
論文発表の現状
Publications Resulting from Experiments at SPring-8

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 346 - 347pdfDownload PDF (26 KB)
SPring-8運転・利用状況
SPring-8 Operational News

(財)高輝度光科学研究センター 所長室 計画調整グループ Planning and Coordination Section, Director's Office, JASRI

Volume 08, No.4 Pages 214 - 215pdfDownload PDF (17 KB)
SPring-8運転・利用状況
SPring-8 Operational News

(財)高輝度光科学研究センター 所長室 計画調整グループ Planning and Coordination Section, Director's Office, JASRI

Volume 08, No.6 Pages 393 - 394pdfDownload PDF (11 KB)
「特定利用 中間評価」について
Intermediate Evaluation of Long-term Proposals

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.4 Page 216pdfDownload PDF (18 KB)
論文発表の現状
Publications Resulting from Experiments at SPring-8

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.6 Pages 395 - 396pdfDownload PDF (22 KB)
「専用ビームライン 中間評価」について
Interim Evaluation of Contract Beamlines

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.4 Page 217pdfDownload PDF (12 KB)
論文発表の現状
Publications Resulting from Experiments at SPring-8

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.4 Pages 218 - 219pdfDownload PDF (24 KB)
長期利用研究課題2004Aの募集について
Call for the Beam Time Application for Long Term Experiments

放射光利用研究促進機構 (財)高輝度光科学研究センター Organization for the Promotion of Synchrotron Radiation Research, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 284 - 285pdfDownload PDF (17 KB)
2004A SPring-8共用ビームライン利用研究課題の募集について
Call for the Beam Time Application for the Public Beamlines at SPring-8

放射光利用研究促進機構 (財)高輝度光科学研究センター Organization for the Promotion of Synchrotron Radiation Research, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 286 - 293pdfDownload PDF (41 KB)
2004A ナノテクノロジー総合支援プロジェクト対象課題の募集について
Call for the Beam Time Application for Nanotechnology Experiments

放射光利用研究促進機構 (財)高輝度光科学研究センター Organization for the Promotion of Synchrotron Radiation Research, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 294 - 296pdfDownload PDF (21 KB)
2004A トライアルユース課題の募集について
Call for the Beam Time Application for Trial Use Experiments

放射光利用研究促進機構 (財)高輝度光科学研究センター Organization for the Promotion of Synchrotron Radiation Research, JASRI

Volume 08, No.5 Page 297pdfDownload PDF (15 KB)
第11回(2003A)利用研究課題の採択について
The Proposals Accepted for Beamtimes in the 11th Public Use Term 2003A

放射光利用研究促進機構 (財)高輝度光科学研究センター 利用業務部
Organization for the Promotion of Synchrotron Radiation Research・JASRI Users Office

Volume 08, No.1 Pages 3 - 19pdfDownload PDF (86 KB)
「特定利用 中間評価」について
Intermediate Evaluation of Long-term Proposals

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 JASRI Users Office

Volume 08, No.1 Page 20pdfDownload PDF (15 KB)
SPring-8運転・利用状況
SPring-8 Operational News

(財) 高輝度光科学研究センター 所長室 計画調整グループ JASRI Planning and Coordination Section, Directorユs Office

Volume 08, No.1 Pages 21 - 22pdfDownload PDF (15 KB)
論文発表の現状
Publications Resulting from Experiments at SPring-8

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 JASRI Users Office

Volume 08, No.1 Pages 23 - 24pdfDownload PDF (23 KB)

2. 最近の研究から/FROM LATEST RESEARCH

高エネルギーX線を用いた“乱れた構造”の精密構造解析
Accurate Structural Analysis of Disordered Materials with High-Energy X-ray Diffraction

小原 真司 KOHARA Shinji[1]、大石 泰生 OHISHI Yasuo[1]、米田 安宏 YONEDA Yasuhiro[2]、松本 徳真 MATSUMOTO Norimasa[2]、鈴谷 賢太郎 SUZUYA Kentaro[2]

[1](財)高輝度光科学研究センター 放射光研究所 JASRI Synchrotron Radiation Research Laboratory
[2]日本原子力研究所 関西研究所 放射光科学研究センター Synchrotron Radiation Research Center, JAERI Kansai Research Establishment

Abstract
With the arrival of the latest generation of synchrotron sources and the introduction of advanced insertion devices (wigglers and undulators), the high-energy (E >=30 keV) X-ray diffraction technique has become feasible, leading to new approaches in the quantitative study of the structure of disordered materials. High-energy X-ray diffraction has several advantages: higher resolution in real space due to a wide range of scattering vector Q, smaller correction terms (especially the absorption correction), reduction of truncation errors, the feasibility of running under extreme environments, including high-temperatures and high-pressures, and the ability to make direct comparisons between X-ray and neutron diffraction data. Recently, high-energy X-ray diffraction data have been combined with neutron diffraction data from a pulsed source to provide more detailed and reliable structural information than that hitherto available. This article reviews and summarizes recent results obtained from the high-energy X-ray diffraction on glass, liquid, amorphus and crystalline materials using bending magnet beamlines at SPring-8.
Volume 08, No.2 Pages 95 - 102pdfDownload PDF (343 KB)
一本の筋原繊維からのX線回折像撮影
X-ray Diffraction Recording from Single Myofibrils

岩本 裕之 IWAMOTO Hiroyuki

(財)高輝度光科学研究センター 利用研究促進部門Ⅱ JASRI Life and Environment Science Division

Abstract
By using the combination of intense X-ray beams from an undulator-based beamline at SPring-8 (BL45XU) and a microbeam optics, we were able to record X-ray diffraction patterns from single myofibrils of a striated muscle (bumblebee flight muscle). Unlike in the conventional method, the muscle cell was irradiated end-on, so that a diffraction pattern from a myofibril was recorded without isolating it from the cell. The recorded pattern consisted of a number of hexagonally arranged spot-like reflections, clearly indicating that the reflections originated from a single hexagonal lattice of myofilaments. Since the muscle cells used were ~3 mm long and contained 1000+ sarcomeres connected in series, the result means that the lattices in these sarcomeres are exactly in register. The achievement opens the possibility that the X-ray diffraction technique may be applied to other micrometer-sized protein assemblies in the cell, such as axonemes and mitotic spindles.
Volume 08, No.2 Pages 103 -106pdfDownload PDF (148 KB)
LEPSの最近の研究状況
Recent Highlights from LEPS

中野 貴志 NAKANO Takashi

大阪大学 核物理研究センター RCNP, Osaka University

Abstract
The GeV photon beam at BL33LEP is produced by backward-Compton scattering of laser photons from 8 GeV electrons. Polarization of the photon beam is nearly 100 % at the maximum energy with fully polarized laser photons. We report the status of the project and some results from first physics run with this high quality beam.
Volume 08, No.3 Pages 177 - 180pdfDownload PDF (178 KB)
SPring-8の時計が一つになった?
Unification of two Clocks at SPring-8

川島 祥孝 KAWASHIMA Yoshitaka、安積 隆夫 ASAKA Takao、高嶋 武雄 TAKASHIMA Takeo

(財)高輝度光科学研究センター 加速器部門 Accelerator Division, JASRI

Abstract
In order to make the beam intensity in each rf bucket in the storage ring uniform, we developed a new synchronization method to synchronize two rf’s of 2856 MHz for the linac and 508.58 MHz for the storage ring. This method can be applied to any combination of arbitrary different rf’s. The method is briefly described.
Volume 08, No.4 Pages 220 - 226pdfDownload PDF (88 KB)
ヒト心筋トロポニンの結晶構造
Crystal structure of the core domain of human cardiac troponin

武田 壮一 TAKEDA Soichi[1]、前田 雄一郎 MAEDA Yuichiro[2]

[1]国立循環器病センター研究所 心臓生理部 Department of Cardiac Physiology, National Cardiovascular Center Research Institute、[2]理化学研究所 播磨研究所 構造生物化学研究室 Laboratory of Structural Biochemistry, Riken Harima Institute

Abstract
Troponin (Tn) plays key roles in the Ca2+ regulation of skeletal and cardiac muscle contraction. It consists of three subunits (TnT, TnC and TnI), and, together with tropomyosin (Tm), is located on the actin filament. We have solved crystal structures of the core domains (relative molecular mass of 46kDa and 52kDa) of human cardiac Tn in the Ca2+-saturated form. The structures reveal that the core domain is further divided into structurally distinct sub-domains that are connected by flexible linkers, making the entire molecule highly flexible. The α-helical coiled-coil formed between TnT and TnI is integrated in a rigid and asymmetric structure (about 80Å long), the IT-arm, which bridges putative Tm-anchoring regions. The structures of Tn ternary complex imply that the Ca2+-binding to the regulatory site of TnC removes the C-terminal portion of TnI from actin/Tm, thereby alters the flexibility of Tn/Tm on the actin filament.
Volume 08, No.5 Pages 348 - 353pdfDownload PDF (251 KB)
新種タンパク質を作る鍵となる酵素のX線結晶構造解析
Crystal structure of a key enzyme for producing novel proteins

小林 隆嗣 KOBAYASHI Takatsugu、横山 茂之 YOKOYAMA Shigeyuki

東京大学大学院 理学系研究科 Graduate School of Science, The University of Tokyo

Abstract
The archaeal/eukaryotic tyrosyl-tRNA synthetase (TyrRS)–tRNATyr pairs do not cross-react with their bacterial counterparts. This ‘orthogonal’ condition is essential for using the archaeal pair to expand the bacterial genetic code. We solved the 1.95 Å-resolution structure of an archaeal TyrRS–tRNATyr–L-tyrosine complex by using the X-ray diffraction data sets collected at the beamline BL41XU, SPring-8. This structure reveals that this archaeal TyrRS strictly recognizes the C1:G72 base pair, whereas the bacterial TyrRS recognizes the G1:C72 in a different manner using different residues. These diverse tRNA recognition modes form the basis for the orthogonality.
Volume 08, No.5 Pages 354 - 358pdfDownload PDF (297 KB)
ベンダーによる偏向電磁石ビームラインのサジタル集光
Synchrotron X-ray focusing by crystal bender

米田 安宏 YONEDA Yasuhiro[1]、松本 徳真 MATSUMOTO Norimasa[1]、古川 行人 FURUKAWA Yukito[2]、石川 哲也 ISHIKAWA Tetsuya[3]

[1]日本原子力研究所 関西研究所 放射光科学研究センター Synchrotron Radiation Research Center, Kansai Research Establishment, JAERI、[2](財)高輝度光科学研究センター ビームライン・技術部門 Beamline Division, JASRI、[3]理化学研究所 播磨研究所 Harima Institute, RIKEN

Abstract
The performance of sagittal focusing for hard X-rays with a cylindrical bent crystal at the SPring-8 is described. The bending mechanism is designed for the SPring-8 standard bending-magnet beamlines. Two-dimensional focusing is achievable by combining sagittal horizontal focusing and vertical focusing mirror. The results underline that the two-dimensional focusing was achieved in the wide energy range by using an adjustable-inclined double crystal monochromator.
Volume 08, No.6 Pages 397 - 400pdfDownload PDF (91 KB)
X線回折法による光励起分子の構造解析
Synchrotron Radiation Structure Analysis of Photo-Excited Molecule

鳥海 幸四郎 TORIUMI Koshiro、小澤 芳樹 OZAWA Yoshiki

姫路工業大学大学院 理学研究科 Himeji Institute of Technology, Graduate School and Faculty of Science

Abstract
For photo-excited crystallography at low temperature using micro-crystals, a new low-temperature vacuum X-ray camera (LTV camera) has been developed and installed at SPring-8 BL02B1. By eliminating X-ray scattering from air and vacuum windows, we successfully obtained high quality data below 80K. we have also developed a special data collection system, multiple exposure IP method, by which both diffraction patterns from the crystal on light irradiated and unirradiated conditions can be recorded on the same image of an IP detector.
Molecular distortion of a photo-excited diplatinum(II) complex in a single crystal has been directly observed by accurate synchrotron radiation studies using the LTV camera and multiple exposure IP method. Photo-excited crystallographic analysis has revealed that a small portion of [Pt2(pop)4]4- (pop=H2O5P22-) complex shows the Pt-Pt bond shrinkage of 0.23 Å under blue laser irradiation.
Volume 08, No.1 Pages 25 - 31pdfDownload PDF (962 KB)

3. 研究会等報告/WORKSHOP AND COMMITTEE REPORT

XAFS12に参加して
The Report on the 12th International Conference of XAFS

谷田 肇 TANIDA Hajime、石井 真史 ISHII Masashi、水牧 仁一朗 MIZUMAKI Masaichiro、加藤 和男 KATO  Kazuo

(財)高輝度光科学研究センター 利用研究促進部門Ⅰ Materials Science Division, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 364 - 366pdfDownload PDF (60 KB)
第3回SPring-8夏の学校を終えて
3rd SPring-8 Summer School

鳥海 幸四郎 TORIUMI Koshiro

姫路工業大学大学院 理学研究科 Graduate School and Faculty of Science, Himeji Institute of Technology

Volume 08, No.5 Pages 367 - 368pdfDownload PDF (56 KB)
文部科学省ナノテクノロジー総合支援プロジェクト
平成14年度放射光グループ研究成果報告会
「放射光利用ナノテク最前線」
Meeting on the Results of FY 2002 Research Activities by the Synchrotron Radiation Research Group of the NanoTechnology Researchers Network Project, MEXT

研究成果報告会 プログラム委員会 Program Committee, Meeting on the Results of Research Actirities

Volume 08, No.5 Pages 369 - 370pdfDownload PDF (35 KB)
X線回折法によるタンパク質の光誘起反応中間体構造解析
〜ヒトヘモグロビンにおける光誘起構造変化の直接観測〜
X-ray structure analysis of photo-induced reaction intermediates of proteins
– Direct observation of photo-induced tertiary structural changes in human hemoglobin –

足立 伸一 ADACHI Shin-ichi[1]、城 宜嗣 SHIRO Yoshitsugu[2]、朴 三用 PARK Sam-Yong[3]、Jeremy R. H. Tame[3]、柴山 修哉 SHIBAYAMA Naoya[4]

[1]高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所 Institute of Materials Structure Science, High Energy Accelerator Research Organization (KEK)、[2]理化学研究所 播磨研究所 Harima Institute, RIKEN、[3]横浜市立大学大学院 総合理学研究科 Graduate School of Integrated Science, Yokohama City University、[4]自治医科大学 生理学講座 Department of Physiology, Jichi Medical School

Abstract
Proteins are encoded in genes and play a wide variety of functions in life. Three dimensional (3-D) protein structures, determined by conventional X-ray crystallographic technique and also by multidimensional nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy, have provided a solid base for understanding their 3-D architecture. However, relatively little information has been extracted from these studies about how the proteins do their tasks, because the 3-D structural information is essentially static. To understand the mechanistic details of how proteins function, it is crucial to know the dynamic features of the events that give rise to their designed functions. We have been working on cryogenic trapping technique of photoactive intermediates of proteins at the BL44B2, SPring-8, and here we present our experimental setup and direct observation of photo-induced tertiary structural changes in human hemoglobin.
Volume 08, No.6 Pages 401 - 405pdfDownload PDF (205 KB)
第6回SPring-8利用技術に関するワークショップ
The 6th Technical Workshop for SPring-8 Utilization
総 括

篭島 靖 KAGOSHIMA Yasushi

姫路工業大学大学院 理学研究科 Himeji Institute of Technology, Graduate School and Faculty of Science

Volume 08, No.2 Pages 107 - 110pdfDownload PDF (42 KB)
新しいナノサイエンス −酸素分子を一列にならべる−
New Nano Science for one-dimensional arrays of dioxygen

高田 昌樹 TAKATA  Masaki[1]、北川 進 KITAGAWA  Susumu[2]、久保田 佳基 KUBOTA  Yoshiki[3]、小林 達生 KOBAYASHI  Tatsuo C.[4]、金道 浩一 KINDO  Koichi[5]、坂田 誠 SAKATA  Makoto[6]

[1](財)高輝度光科学研究センター 利用研究促進部門Ⅰ Material Science Division, JASRI、[2]京都大学大学院 工学研究科 Graduate School of Engineering, Kyoto University、[3]大阪女子大学 理学部 Faculty of Science, Osaka Women's University、[4]岡山大学 理学部 Faculty of Science, Okayama University、[5]大阪大学 極限科学研究センター Research Center for Materials Science at Extreme Conditions, Osaka University、[6]名古屋大学大学院 工学研究科 Graduate School of Engineering, Nagoya University

Abstract
We report the direct observation of dioxygen molecules physisorbed in the nanochannels of a microporous copper coordination polymer by the MEM (maximum entropy method)/Rietveld method, using in situ high-resolution synchrotron x-ray powder diffraction measurements. The obtained MEM electron density revealed that van der Waals dimers of physisorbed O2 locate in the middle of nanochannels and form a one-dimensional ladder structure aligned to the host channel structure. The observed magnetic susceptibilities is characteristic of the confined O2 molecules in one-dimensional nanochannels of CPL-1 (coordination polymer 1 with pillared layer structure).
Volume 08, No.6 Pages 406 - 412pdfDownload PDF (598 KB)
(第6回SPring-8利用技術に関するワークショップ)
X線発光分光
Present Status and Future Prospects of XES at SPring-8

七尾 進 NANAO Susumu

東京大学 生産技術研究所 Institute of Industrial Science, University of Tokyo

Volume 08, No.2 Page 111pdfDownload PDF (12 KB)
tRNA修飾酵素による構造変化したtRNAの認識機構
Alter native Tertiary Structure of tRNA for Recognition by a Post – Transcriptional Modification Enzyme

石谷 隆一郎 ISHITANI Ryuichiro、横山 茂之 YOKOYAMA Shigeyuki

東京大学大学院 理学系研究科 Graduate School of Science, The University of Tokyo

Abstract
Transfer RNA (tRNA) canonically has the clover-leaf secondary structure with the acceptor, D, anticodon, and T arms, which are folded into the L-shaped tertiary structure. To strengthen the L form, post-transcriptional modifications occur on nucleotides buried within the core, but the modification enzymes are paradoxically inaccessible to them in the L form. In this study, we determined the crystal structure of tRNA bound with archaeosine tRNA-guanine transglycosylase, which modifies G15 of the D arm in the core, by using the X-ray diffraction data set collected at BL41XU, SPring-8. The bound tRNA assumes an alternative conformation (“λform”) drastically different from the L form. All of the D arm secondary base pairs and the canonical tertiary interactions are disrupted. Furthermore, a helical structure is reorganized, while the rest of the D arm is single-stranded and protruded. Consequently, the enzyme precisely locates the exposed G15 in the active site, by counting the nucleotide number from G1 to G15 in the λform.
Volume 08, No.6 Pages 413 - 415pdfDownload PDF (116 KB)
(第6回SPring-8利用技術に関するワークショップ)
SPring-8利用研究の最前線

植木 龍夫  UEKI Tatsuo

(財)高輝度光科学研究センター 利用研究促進部門 JASRI Life and Environment Science Division

Volume 08, No.2 Pages 112 - 113pdfDownload PDF (21 KB)
(第6回SPring-8利用技術に関するワークショップ)
高エネルギーX線 不規則系物質の構造解析の最近の進展
−SPring-8の高強度単色高エネルギーX線を用いた精密構造解析−

鈴谷 賢太郎 SUZUYA Kentaro

日本原子力研究所 放射光科学研究センター Synchrotron Radiation Research Center, JAERI

Volume 08, No.2 Pages 114 - 115pdfDownload PDF (18 KB)
平成14年度の諮問委員会等の活動状況
Activities of the SPring-8 Advisory Committee and the Others in the 2002 Fiscal Year

放射光利用研究促進機構(財)高輝度光科学研究センター 企画調査部 Organization for the Promotion of Synchrotron Radiation Research . Research and Planning Division, JASRI

Volume 08, No.3 Pages 181 - 185pdfDownload PDF (132 KB)
SPring-8放射光による応力評価研究分科会の成果
Activities of Research Committee on Stress Evaluation by SPring-8

古池 治孝 KOIKE Harutaka

(財)高輝度光科学研究センター 利用業務部 User Administration Division, JASRI

Volume 08, No.4 Pages 227 - 232pdfDownload PDF (171 KB)
高エネルギー放射光による応力評価の国際動向と測定標準化
Study and International Standard on Stress Analysis with High Energy Synchrotron X-rays

鈴木 賢治 SUZUKI Kenji

新潟大学 教育人間科学部 Faculty of Education and Human Sciences, Niigata University

Volume 08, No.4 Pages 233 - 237pdfDownload PDF (65 KB)
2003年Particle Accelerator Conferenceに参加して
2003 Particle Accelerator Conference

青木 毅 AOKI Tsuyoshi、早乙女 光一 SOUTOME Koichi、小路 正純 SHOJI Masazumi、妻木 孝治 TSUMAKI Koji

(財)高輝度光科学研究センター 加速器部門 Accelerator Division, JASRI

Volume 08, No.4 Pages 238 - 242pdfDownload PDF (34 KB)
三極ミーティング(APS)に同行して The Three-Way Meeting at APS

當眞 一裕 TOHMA Kazuhiro

(財)高輝度光科学研究センター 所長室 研究事務グループ Research Secretariat, Director’s Office, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 359 - 363pdfDownload PDF (72 KB)
第5回SRRTNetワークショップ
「理論・計算・実験間のインターフェース」報告
Report on the 5th SRRTNet Workshop
“Interface Between Theory, Computation and Experiments”

小谷 章雄 KOTANI Akio[1]、馬越 健次 MAKOSHI Kenji[2]

[1]東京大学 物性研究所 Institute for Solid State Physics, the University of Tokyo、
[2]姫路工業大学大学院 理学研究科 Himeji Institute of Technology, Graduate School and Faculty of Science

Volume 08, No.1 Pages 32 - 33pdfDownload PDF (40 KB)
加速器アライメント国際会議(IWAA2002)を開催して
Host Report of the 7th International Workshop on Accelerator Alignment

松井 佐久夫  MATSUI Sakuo

(財)高輝度光科学研究センター 放射光研究所 加速器部門 JASRI Accelerator Division

Volume 08, No.1 Pages 34 - 39pdfDownload PDF (161 KB)
第2回軌道安定化ワークショップ
Workshop on Beam Orbit Stabilization

高雄 勝 TAKAO Masaru

(財)高輝度光科学研究センター 放射光研究所 加速器部門 JASRI Accelerator Division

Volume 08, No.1 Pages 40 - 43pdfDownload PDF (45 KB)
「利用者情報」掲載のビームライン情報について
Volume 08, No.1 Page 43pdfDownload PDF (11 KB)
(第6回SPring-8利用技術に関するワークショップ)
超高圧・超高温科学の放射光利用による新展開を目指して

清水 克哉 SHIMIZU Katsuya

大阪大学大学院 基礎工学研究科 Graduate School of Engineering Science, Osaka University

Volume 08, No.2 Page 116pdfDownload PDF (13 KB)
理研シンポジウム 構造生物学(VIII)
「蛋白質複合体の構造生物学:構造からメカニズムの理解へ」を開催して
RIKEN Symposium on Structural Biology (VIII)
“Structural Biology of Protein Complexes : from Structure to Mechanisms”

小田 俊郎 ODA Toshiro

理化学研究所 播磨研究所 構造生物化学研究室 RIKEN Harima Institute at SPring-8,Lab of Structural Biochemistry

Volume 08, No.2 Pages 117 - 119pdfDownload PDF (41 KB)
「SPring-8利用者情報」送付先登録票
Registration Form for This Journal
Volume 08, No.2 Page 121pdfDownload PDF (16 KB)

4. 播磨科学公園都市ガイドブック/HANDY TIPS AROUND HARIMA SCIENCE GARDEN CITY

SPring-8各部門の配置と連絡先
Phone and Fax Numbers in SPring-8
Volume 08, No.2 Pages 122 - 123pdfDownload PDF (76 KB)
SPring-8へのアクセス
Access Guide to SPring-8
Volume 08, No.2 Pages 124 - 128pdfDownload PDF (71 KB)
播磨科学公園都市マップ
Harima Science Garden City Map
Volume 08, No.2 Page 129pdfDownload PDF (44 KB)
宿泊施設
Hotels and Inns
Volume 08, No.2 Pages 130 - 131pdfDownload PDF (22 KB)
西播磨の文学碑巡り(I)
My Pilgrimage to Literary Stone Monuments in and around West Harima (Part 1)

尾崎 隆吉 OZAKI Takayoshi

(財)高輝度光科学研究センター 広報室 Public Relations Office, JASRI

Volume 08, No.3 Pages 186 - 194pdfDownload PDF (238 KB)
利用者懇談会からIII
From the President of the SPring-8 Users Society III

坂田 誠 SAKATA Makoto

SPring-8利用者懇談会  会長 名古屋大学大学院  工学研究科 Graduate School of Engineering,Nagoya University

Volume 08, No.4 Pages 243 - 245pdfDownload PDF (24 KB)
播磨の刀工
Japanese Swordsmith in Harima

髙見 千晴 TAKAMI Chiharu

(財)高輝度光科学研究センター 利用研究促進部門Ⅰ Materials Science Division, JASRI

Volume 08, No.5 Pages 371 - 374pdfDownload PDF (108 KB)
第3回サンビーム研究発表会
The 3rd SUNBEAM Workshop

上原 康 UEHARA Yasushi

三菱電機㈱ 先端技術総合研究所 Advanced Technology R&D Center, Mitsubishi Electric Co.

Volume 08, No.6 Pages 416 - 418pdfDownload PDF (24 KB)
「SPring-8利用者情報Vol. 7(2002年発行)」バックナンバーの紹介
“SPring-8 Information Vol. 7” Back Numbers
Volume 08, No.1 Pages 44 - 46pdfDownload PDF (42 KB)
レストラン・食堂
Restaurants
Volume 08, No.2 Pages 132 - 134pdfDownload PDF (18 KB)
西播磨の文学碑巡り(II)
My Pilgrimage to Literary Stone Monuments in and around West Harima (Part 2)

尾崎 隆吉 OZAKI Takayoshi

(財)高輝度光科学研究センター 広報室 Public Relations Office, JASRI

Volume 08, No.4 Pages 246 - 258

5. 告知板/ANNOUNCEMENTS

第7回SPring-8シンポジウム開催のご案内
The 7th SPring-8 Symposium Announcement
Volume 08, No.4 Page 259pdfDownload PDF (15 KB)
「SPring-8 Research Frontiers」表紙デザインの募集
Call for cover design of “SPring-8 Research Frontiers”
Volume 08, No.6 Pages 420 - 421pdfDownload PDF (14 KB)
「SPring-8施設公開」〜その目で見よう!世界一のSPring-8!!〜
Report of the SPring-8 OPEN HOUSE 2003

SPring-8施設公開実行委員会事務局

Volume 08, No.4 Pages 262 - 265pdfDownload PDF (106 KB)
独立行政法人理化学研究所・播磨研究所 研究員公募
Job Opportunity at RIKEN Harima Institute
Volume 08, No.6 Page 422pdfDownload PDF (12 KB)
相生ペーロン祭り参加
Aioi PERON Festival

財団法人高輝度光科学センター 総務部

Volume 08, No.4 Pages 266 - 268pdfDownload PDF (60 KB)
「SPring-8利用者情報」送付先登録票
Registration Form for the Issue of “SPring-8 Information”
Volume 08, No.5 Page 378pdfDownload PDF (81 KB)
SPring-8は兵庫情報ハイウェイ500MbpsでSINETに高速接続を開始
SPring-8 Internet Connection Through the Hyogo Information Highway 500Mbps to the SINET

武部 英樹 TAKEBE Hideki、間山 皇 MAYAMA Ko、酒井 久伸 SAKAI Hisanobu、瀬崎 勝二 SEZAKI Katsuji

(財)高輝度光科学研究センター JASRI

Volume 08, No.3 Pages 195 - 198pdfDownload PDF (148 KB)
宿泊料金の研究者特別割引のご案内
Information on a Special Discount on Lodging Charges for Researchers
Volume 08, No.3 Page 199pdfDownload PDF (14 KB)
宿泊料金の研究者特別割引のご案内
Information on a Special Discount on Room Rates to Researchers
Volume 08, No.4 Page 269pdfDownload PDF (13 KB)
刊行物の発行について
SPring-8 Publication
Volume 08, No.4 Page 270pdfDownload PDF (14 KB)
第7回SPring-8シンポジウム開催のご案内
The 7th SPring-8 Symposium Announcement
Volume 08, No.5 Page 377pdfDownload PDF (15 KB)
SPring-8各部門の配置と連絡先
Phone and Fax Numbers in SPring-8
Volume 08, No.1 Pages 47 - 48pdfDownload PDF (83 KB)
SPring-8へのアクセス
Access Guide to SPring-8
Volume 08, No.1 Pages 49 - 52pdfDownload PDF (51 KB)
播磨科学公園都市マップ
Harima Science Garden City Map
Volume 08, No.1 Page 53pdfDownload PDF (48 KB)
宿泊施設
Hotels and Inns
Volume 08, No.1 Pages 54 - 55pdfDownload PDF (16 KB)
「SPring-8利用者情報」送付先登録票
Registration Form for This Journal
Volume 08, No.3 Page 200pdfDownload PDF (205 KB)
レストラン・食堂
Restaurants
Volume 08, No.1 Pages 56 - 58pdfDownload PDF (22 KB)
「SPring-8利用者情報」送付先登録票
Registration Form for This Journal
Volume 08, No.1 Page 59pdfDownload PDF (16 KB)

6. 播磨科学公園都市ガイドブック/HANDY TIPS AROUND HARIMA SCIENCE GARDEN CITY

SPring-8各部門の配置と連絡先
SPring-8 Campus Guide and Contact Numbers
Volume 08, No.4 Pages 271 - 273pdfDownload PDF (93 KB)
SPring-8各部門の配置と連絡先
Phone and Fax Numbers in SPring-8
Volume 08, No.3 Pages 201 - 202pdfDownload PDF (3 MB)
SPring-8へのアクセス
Access Guide to SPring-8
Volume 08, No.4 Pages 274 - 278pdfDownload PDF (79 KB)
SPring-8へのアクセス
Access Guide to SPring-8
Volume 08, No.3 Pages 203 - 206pdfDownload PDF (373 KB)
播磨科学公園都市マップ
Harima Science Garden City Map
Volume 08, No.4 Page 279pdfDownload PDF (54 KB)
播磨科学公園都市マップ
Harima Science Garden City Map
Volume 08, No.3 Pages 207pdfDownload PDF (229 KB)
宿泊施設
Hotels and Inns

所属
Affiliation

Volume 08, No.4 Pages 280 - 281pdfDownload PDF (22 KB)
SPring-8各部門の配置と連絡先
SPring-8 Campus Guide and Contact Numbers
Volume 08, No.6 Pages 424 - 426pdfDownload PDF (90 KB)
SPring-8へのアクセス
Access Guide to SPring-8
Volume 08, No.6 Pages 427 - 431pdfDownload PDF (60 KB)
宿泊施設
Hotels and Inns
Volume 08, No.3 Pages 208 - 209pdfDownload PDF (18 KB)
レストラン・食堂
Restaurants
Volume 08, No.3 Pages 210 - 212pdfDownload PDF (22 KB)
レストラン・食堂
Restaurants
Volume 08, No.4 Pages 282 - 284pdfDownload PDF (18 KB)
「SPring-8利用者情報」送付先登録票
Registration Form for the Issue of “SPring-8 Information”
SPring-8各部門の配置と連絡先
SPring-8 Campus Guide and Contact Numbers
Volume 08, No.5 Pages 379 - 381pdfDownload PDF (95 KB)
SPring-8へのアクセス
Access Guide to SPring-8
Volume 08, No.5 Pages 382 - 385pdfDownload PDF (360 KB)
播磨科学公園都市マップ
Harima Science Garden City Map
Volume 08, No.5 Page 386pdfDownload PDF (55 KB)
宿泊施設
Hotels and Inns
Volume 08, No.5 Page 387pdfDownload PDF (20 KB)
播磨科学公園都市マップ
Harima Science Garden City Map
Volume 08, No.6 Page 432pdfDownload PDF (52 KB)
レストラン・食堂
Restaurants
Volume 08, No.5 Pages 389 - 341pdfDownload PDF (26 KB)
宿泊施設
Hotels and Inns
Volume 08, No.6 Pages 433 - 434pdfDownload PDF (20 KB)
レストラン・食堂
Restaurants
Volume 08, No.6 Pages 435 - 437pdfDownload PDF (16 KB)
「SPring-8利用者情報」送付先登録票
Registration Form for the Issue of “SPring-8 Information”

その他/MISC

目次
Table of Contents
編集委員会
Editorial Board
表紙
Cover
裏表紙
Back Cover
目次
Table of Contents
目次
Table of Contents
編集委員会
Editorial Board
編集委員会
Editorial Board
表紙
Cover
表紙
Cover
裏表紙
Back Cover
裏表紙
Back Cover
目次
Table of Contents
編集委員会
Editorial Board
表紙
Cover
裏表紙
Back Cover
目次
Table of Contents
編集委員会
Editorial Board
表紙
Cover
裏表紙
Back Cover
目次
Table of Contents
編集委員会
Editorial Board
表紙
Cover
裏表紙
Back Cover

SPring-8/SACLA INFORMATION

ISSN 1341-9668 EISSN 2187-4794